各社の主祭神は、地主神である九頭龍大神（くずりゅうのおおかみ）以外は「天照大神（あまてらすおおみかみ）が、弟である素戔嗚尊（すさのおのみこと）の度重なる非行を嘆いて天岩戸（あまのいわと）に隠れたため、この世に暗黒と悪神がはびこった」とされる神話にまつわる神であるが、それぞれがいつ頃から現在の祭神を祀るようになったかは必ずしも明らかでない。しかし他の多くの神仏習合の神社とは異なり、祭神は江戸時代以前から変わっていない。
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宝光社（ほうこうしゃ）：現在地への鎮座は康平元年(1058年)、天暦3年(949年)に奥社の相殿として創建されたものである。祭神は天表春命（あめのうわはるのみこと）で、中社の祭神である天八意思兼命の子。学問や技芸、裁縫、安産や婦女子の神とされる。麓から登ってきて最初にあり、うっそうとした杉木立の階段を上って参拝する。旧宝光院。
火之御子社（ひのみこしゃ、日之御子社とも書く）：創建は天福元年（1233年）。祭神は天鈿女命（あめのうずめのみこと）。他に高皇産霊命（たかむすびのみこと）、その娘である栲幡千々姫命（たくはたちちひめのみこと）、栲幡千々姫命の夫である天忍穂耳命（あめのおしほみみのみこと）を祀る。天鈿女命は天照大神が隠れた天岩戸の前で面白おかしく踊って天照大神を誘い出すきっかけをつくったとされる女神。舞楽や芸能、また火防の神とされ、宝光社の上1.5kmほどの場所にある。尚、他の4社が神仏混淆であった時代も当社だけは一貫して神社であって、かつての顕光寺とは関係がない。